两厢车和三厢车在以下六个方面存在区别：
1. 外观结构：两厢车的驾驶室、发动机、后备箱是合并在一起的，而三厢车的三个厢则是独立分开，将所有功能都划分清楚。两厢车的车长较短，尾箱空间较小，而三厢车的车长较长，后尾箱空间更大。
2. 空间：两厢车在相同轴距的情况下，长度更短，相对空间更小。而三厢车因为多出一个后备箱，整体空间会更大，尤其体现在车的后排空间上，不仅可以坐下更多乘客，乘坐的舒适性也较好。
3. 安全性：三厢车因为多出一个后备箱，所以发生追尾的时候会有一个缓冲区，侧面反映两厢车不安全。
4. 噪音：两厢车的噪音相对较大，尤其在高速的时候，而三厢车的内部噪音控制较好。
5. 灵活性：两厢车的空间变化灵活，后排放倒以后可以运大件物品，而三厢车则不能。
6. 品牌：桑塔纳、捷达、奥迪A6多为三厢车，富康、奥拓等车是两厢车。
两厢车和三厢车在外观结构、空间、安全性、噪音、灵活性和品牌等方面存在区别，您可以根据自己的需求和喜好来选择适合自己的车型。